- c -

• checkCudaError() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• checkPBC() : gpu_tools.cuh
• componentSumReduction() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• copyDevToDev() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh

- g -

• generateRestartScript() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• generateScript() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• generateStartScript() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• getHarmonicPotentialEnergy() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• getKineticEnergy() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• getLJCutPotentialEnergy() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuAddHarmonicBondForce() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuAddLJForce() : gpu_forces.cuh , gpu_forces.cu
• gpuAddLJForceCut() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuComponentSumReduce1() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuComponentSumReduce2() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuCumulateVec() : gpu_tools.cuh
• gpuDistPBC() : gpu_tools.cuh
• gpuGenerateVerletList() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuGenerateVerletListSmem() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuGenerateVerletListSmemVar1() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuGenerateVerletListVar1() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• gpuGetHarmonicPotentialEnergyKernel() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuGetVelOnTime() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuHarmonicBondForces() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuHarmonicBondForcesSmem() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuInitialBackstep() : gpu_integrator.cu , gpu_integrator.cuh
• gpuIntegratorLeapFrog() : gpu_integrator.cu , gpu_integrator.cuh
• gpuLJCutPotentialEnergyKernel() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuLJForces() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuLJForcesCut() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuLJForcesCutRSmem() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuLJForcesCutSmem() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuLJForcesCutSmemSmem() : gpu_forces.cuh , gpu_forces.cu
• gpuLJForcesCutVar1() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuLJForcesSmem() : gpu_forces.cuh , gpu_forces.cu
• gpuLJForcesSmemSmem() : gpu_forces.cuh , gpu_forces.cu
• gpuLJForcesVerletList() : gpu_forces.cuh , gpu_forces.cu
• gpuReduce1() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuReduce2() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• gpuRemoveDriftKernel() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• gpuRescaleTKernel() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• gpuResetForces() : gpu_forces.cu , gpu_forces.cuh
• gpuRnd() : gpu_tools.cuh
• gpuSimpleComponentSum() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuSimpleSqSum() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• gpuSqSumReduce1() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu

- l -

• loadInitData() : data.cpp , data.h
• loadPosVelFromFile() : data.cpp , data.h

- m -

• main() : main.cu
• memInfo() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu

- r -

• removeDrift() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• rescaleT() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh

- s -

• setCudaDevice() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• showDeviceArray() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• showForces() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• showNeareastNeighborList() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• showPositions() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• showVelocities() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• showVerletList() : gpu_tools.cu , gpu_tools.cuh
• SqVecSumReduction() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu
• sumReduction() : gpu_tools.cuh , gpu_tools.cu

- w -

• writeData() : data.cpp , data.h